正當《EVA》餘韻不絕的同時,動畫演出家佐藤竜雄在該年成功推出生涯中的動畫監督處女作《機動戦艦ナデシコ Martian Successor Nadesico》(機動戰艦)。本片一方面有著『美少女初次當上宇宙戰艦的艦長』設定的硬式科幻要素(Hard SF,科幻世界觀緊密地遵順著科學定律。),另一方面又存在著洋溢70年代巨大機器人動畫風格的劇中劇《ゲキ・ガンガー3》(激鋼牙3),因此為本片招來廣大的話題。蘊藏在箇中的本質,其實是讓一同走過電視動畫歷史的動畫迷(製作群和觀眾群)透過劇情而體悟出,包含『自我批判』與『自我肯定』的兩面性。
大手集團「日本索尼影視娛樂」(Sony Pictures Entertainment Japan lnc.,簡稱SPEJ)在該年1月10日正式進軍電視螢光幕,出資監製一部改編自和月伸宏同名漫畫、由古橋一浩監督的古裝動畫《るろうに剣心 -明治剣客浪漫譚-》(神劍闖江湖)。接著,改編自漫畫家矢上裕同名人氣連載、由片山一良監督的動畫版《エルフを狩るモノたち》(妖精狩獵者)於10月4日放送。尤其是《妖精狩獵者》因為破天荒打出『深夜アニメ』名號,正式為深夜動畫時代揭開序幕。